Komunikaci mezi počítačem a mikrokontrolerem lze realizovat několika různými způsoby, které se od sebe liší na všech úrovních. I dnes je velmi oblíbené propojení pomocí sběrnice UART, která je obsažena téměř ve všech používaných mikrokontrolerech. Následné propojení s počítačem se realizuje propojením s konektorem COM v napěťových úrovních ± 12 V (známý jako RS232). Potřeba odlišných napěťových úrovní vyžaduje připojení napěťového převodníku označených jako MAX232 apod. Konektory COM se v poslední době z počítačů vytrácejí a na noteboocích se vyskytují pouze vyjímečně. Proto se hledají jiné cesty pro komunikaci mezi počítači a mikrokontrolery. Jednou z možných cest je komunikace přes USB.